Ingénieur biologie - ingénierie cellulaire, automatisation F/H

Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels. Labelisée HR Excellence in Research par la Commission européenne depuis 2021, Sorbonne Université porte une stratégie ambitieuse au service de l'ensemble de sa communauté de recherche.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au coeur de Paris, elle présente une organisation avec des directions inter-facultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 30 sites en Ile-de-France et en régions.

CDD de 1 an.

Le rôle principal du poste consiste à déployer l'activité de production de lignées cellulaires stables à haut débit, en assurant la continuité du pipeline entre la DNA Biofoundry et la Biofonderie Mammalienne. Il/Elle garantira l'interface avec les équipes afin d'identifier les besoins des projets et de les traduire en protocoles robustes, traçables et compatibles avec l'automatisation.

Activités principales :
Ingénierie cellulaire & production automatisée (haut débit) :
Adapter et optimiser les conditions de culture et de transfection pour différentes lignées cellulaires mammaliennes
Concevoir et déployer des protocoles de transfection (lipofection, électroporation) à l'échelle robotique
Opérer et programmer les systèmes robotisés (pipetage Hamilton, transfert acoustique) pour la manipulation des fluides
Définir les stratégies de sélection (antibiotique, cytométrie/FACS), isoler des clones monoclonaux et assurer leur expansion

Caractérisation, imagerie & analyse (high-content screening) :
Valider les clones générés via des approches d'imagerie confocale
Caractériser les lignées (microscopie confocale) afin de confirmer stabilité et fonctionnalité des inserts
Assurer la traçabilité du processus et l'analyse des données (imagerie, contrôles qualité)

Pilotage de l'activité & gestion de la plateforme :
Assurer le maintien, la caractérisation et la cryoconservation des lignées cellulaires
Rédiger et mettre à jour les SOPs pour garantir la reproductibilité des opérations
Gérer les consommables et organiser la maintenance préventive des équipements partagés (incubateurs, PSM)
Assurer le lien avec les équipes de la Biofonderie et les porteurs des projets


PROFIL RECHERCHE :
Connaissances transversales requises :
Maîtrise des techniques de transfection et de culture de lignées cellulaires, établissement de lignées stables et monoclonales (dilution limite, tri par cytométrie/FACS)
Connaissance pratique indispensable sur les stations de pipetage automatisées
Expertise en biologie moléculaire, microscopie confocale et analyse d'images sont des atouts
Maîtrise des fondamentaux scientifiques et numériques
Connaissance approfondie des méthodologies de biologie moléculaire et d'ingénierie génomique (clonages haut débit, CRISPR-Cas9, modélisation de réarrangements chromosomiques complexes, transgénèse)
Excellentes connaissances théoriques et pratiques de la culture, de l'ingénierie, de la sélection clonale et du phénotypage des cellules mammaliennes (lignées tumorales complexes, cellules primaires)
Connaissances théoriques et pratiques approfondies en biologie cellulaire et oncologie
Connaissances de base en programmation Python et appétence pour le développement d'outils numériques

Connaissances transversales requises (suite) :

• Notions d'informatique appliquée à l'automatisation des transferts de liquide (robots de pipetage/clonage) et à la gestion informatisée de collections et banques cellulaires
• Réglementation en matière d'Hygiène et de Sécurité en environnement de confinement (L2/L3)
• Langue anglaise : B2 à C1 (anglais scientifique opérationnel)

Savoir-faire :

• Concevoir en expert de nouvelles techniques d'ingénierie cellulaire (transfections de lignées complexes, criblage et sélection clonale, phénotypage fonctionnel)
• Utiliser avec aisance les logiciels spécifiques à l'activité (bio-informatique, outils d'analyse et gestion de données : R, GraphPad Prism
• Rédiger des documents scientifiques (protocoles complexes, rapports, manuscrits pour des revues internationales à comité de lecture) et assurer la gestion autonome de projets entrants et sortants
• Développer une expertise scientifique et technologique de pointe à l'interface entre l'ingénierie du génome et le criblage phénotypique
• Gérer la confidentialité des projets et appliquer les règles liées à la propriété intellectuelle et à l'intégrité scientifique

Savoir-être :

• Organisation et Rigueur : Indispensables pour garantir la traçabilité complète des banques cellulaires et la gestion de projets multiples en parallèle
• Autonomie : Capacité à optimiser des protocoles de manière indépendante et à résoudre les problèmes techniques (troubleshooting)
• Esprit d'équipe : Aptitude à travailler dans un environnement collaboratif multi-sites (interface Curie/Sorbonne) et à reporter efficacement les avancées
• Sensibilité aux enjeux de délais et de qualité propres à une plateforme de service et de recherche technologique

Diplôme réglementaire souhaité :

• Niveau et diplômes souhaités : Doctorat, diplôme d'ingénieur en Biologie Cellulaire, Biologie Moléculaire, Biotechnologie ou domaine équivalent
• Expériences professionnelles souhaitées : Expérience (minimum 2 à 3 ans) en laboratoire de recherche ou plateforme technologique. Une expérience confirmée dans la génération de lignées cellulaires stables (du design à la validation) est indispensable. La pratique du criblage à haut-débit ou de l'automatisation en biologie est un atout majeur

Choisir Sorbonne Université, c’est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d’égalité, d’innovation, de diffusion des savoirs, d’ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s’attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au cœur de Paris, elle présente une organisation avec des directions interfacultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Ile-de-France et en régions.