Entreprise :
Les agrumes représentent la culture d’arbres fruitiers la plus importante au monde. En Corse, c’est la deuxième production agricole en valeur économique. Cependant, l’agrumiculture doit faire face à de nombreux stress environnementaux, dont l’infection par l’oomycète phytopathogène Phytophthora citrophthora, responsable de pertes de rendements allant jusqu’à 30 %.
Dans un contexte de réduction de l’utilisation des intrants chimiques, l’amélioration génétique et le développement de nouvelles variétés revêtent une importance particulière. Pour lutter contre les infections à Phytophthora et développer de nouvelles variétés résistantes ou tolérantes, il est nécessaire de mieux comprendre les impacts du pathogène sur la physiologie des plantes. Il est également essentiel d’identifier les déterminismes biochimiques et génétiques de la résistance ou de la tolérance chez les agrumes.
Dans le cadre du projet ANR PIA UNITI et d’une thèse de doctorat menée en collaboration entre INRAE et l’Université de Corse, nous étudions une core-collection de 250 accessions représentatives de la diversité des agrumes. L’objectif est d’analyser leur réponse à l’infection par P. citrophthora afin d’identifier des accessions porteuses de gènes de résistance et/ou de tolérance, ainsi que des mécanismes de défense associés. L’inoculation du pathogène, suivie du phénotypage quantitatif des symptômes et des marqueurs biochimiques, ainsi que le génotypage de la core-collection, serviront ultérieurement de base à une étude de génétique d’association de type Genome-Wide Association Study (GWAS).
Missions :
C’est dans ce contexte que s’inscrit le présent stage, qui se concentrera sur un sous-ensemble de 20 accessions de la core-collection. Ses principales missions seront donc les suivantes :
Stage de 6 mois.
Ce stage permettra à l’étudiant.e d’acquérir des compétences en microbiologie, phénotypage, enzymologie, analyses statistiques et analyse de données bio-informatiques.
ANALYSE DE LA RÉPONSE DES AGRUMES À PHYTOPHTHORA CITROPHTHORA POUR L’IDENTIFICATION DE MÉCANISMES DE RÉSISTANCE F/H • Cervione, Haute-Corse, France
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