Magasin bio • montigny le bretonneux 78
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Mission
Dans le cadre de l’action A2-LINE « Accompagnement et Accélération de L’Innovation Emergente » co-financée par la Région Ile-de-France dans le cadre du FEDER et portée par la SATT Paris-Saclay, l’Institut Polytechnique de Paris, et l’Université Paris-Saclay, le laboratoire UMR1173 Infection et Inflammation Équipe IRIS a obtenu un financement pour développer le potentiel d’application de ses résultats de recherche dans le cadre du projet “De la stratification clinique à l’immunoprofilage dans la spondyloarthrite axiale : caractérisation multiparamétrique des lymphocytes T CD4⁺ CCR6⁺CXCR3.”
Dans ce cadre, l’Université recrute un/une postdoctorant( ) Projet Innovant.
Le Laboratoire
L’UMR INSERM 1173 « Infection et Inflammation » (2I) est une unité mixte de recherche de l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ/Université Paris-Saclay) et de l’INSERM, implantée au sein de l’UFR Simone Veil santé à Montigny-le-Bretonneux. Ses travaux visent à comprendre les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans les réponses inflammatoires et infectieuses, en développant une approche translationnelle allant des modèles expérimentaux jusqu’aux études cliniques chez l’Homme.
Au sein de cette unité, l’équipe IRIS (Inflammation Rhumatismal et système immunitaire), dirigée par le Pr Maxime Breban, est internationalement reconnue pour ses recherches sur les spondyloarthrites (SpA). Ses travaux portent notamment sur les interactions entre prédisposition génétique (en particulier HLA‑B27), microbiote intestinal et système immunitaire dans le développement des SpA. L’équipe utilise des approches complémentaires associant cohortes de patients, analyses immunologiques et modèles expérimentaux afin de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques de la spondyloarthrite et d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques. L’équipe IRIS a notamment contribué à faire progresser le concept de l’axe intestin–articulation dans la SpA, en étudiant comment certaines bactéries du microbiote peuvent moduler les réponses immunitaires et favoriser l’inflammation articulaire chez des hôtes génétiquement prédisposés. Ce projet a pour objectif de développer et valider un pipeline analytique intégratif innovant pour transformer des critères cliniques en signatures immunologiques exploitables en médecine de précision.
Mission et positionnement de l’agent.e :
Le projet global se déroule selon une progression structurée en plusieurs phases. Dans un premier temps, les 3 premiers mois seront consacrés à l’analyse des données de cytométrie spectrale déjà acquises. Cette phase permettra d’obtenir une première caractérisation phénotypique détaillée. Au cours de la période suivante, entre M3 et M6, le candidat réalisera les étapes de contrôle qualité et de prétraitement des données permettant les analyses des données séquençage sur cellule unique des ARN et du TCR ainsi que analyses fonctionnelles protéiques de manière indépendantes. Enfin dans le dernier temps entre M6 et M12, les comparaisons entre endotypes seront menées avec une intégration multi-omique permettant d’identifier des signatures discriminantes, suivie d’un travail de simplification en vue de la transposition clinique. Les principaux jalons du projet sont l’obtention d’un jeu de données complet en cytométrie, la disponibilité des données multi-omiques intégrées, l’identification de signatures biologiques robustes et la définition d’une signature candidate transposable en pratique.
Connaissance, savoir :
La personne recrutée devra maîtriser les outils d’analyse de séquençage et une bonne maîtrise des langages de programmation R et Python. Des compétences en statistiques avancées sont essentielles pour la modélisation des données et la prise en compte de la variabilité biologique. La capacité à gérer des jeux de données volumineux et complexes, ainsi qu’à produire des visualisations claires et interprétables, est également attendue. Une expérience dans des projets interdisciplinaires impliquant des interactions entre cliniciens et biologistes constituera un atout important.
Savoir-faire : Maîtriser les outils d’analyse bioinformatique de séquençage et des langages de programmation R et Python
Savoir-être :
Née de la volonté conjuguée d’universités, de grandes écoles et d’organismes de recherche, l’Université Paris-Saclay compte parmi les grandes universités européennes et mondiales, couvrant les secteurs des Sciences et Ingénierie, des Sciences de la Vie et Santé, et des Sciences Humaines et Sociales. Sa politique scientifique associe étroitement recherche et innovation, et s’exprime à la fois en sciences fondamentales et en sciences appliquées pour répondre aux grands enjeux sociétaux. Du premier cycle au doctorat, en passant par des programmes de grandes écoles, l’Université Paris-Saclay déploie une offre de formation sur un large spectre de disciplines, au service de la réussite étudiante et de l'insertion professionnelle. Elle prépare les étudiants à une société en pleine mutation, où l’esprit critique, l’agilité et la capacité à renouveler ses compétences sont clés. L’Université Paris-Saclay propose également un riche programme de formations tout au long de la vie. Située au sud de Paris sur un vaste territoire, l'Université Paris-Saclay bénéficie d’une position géographique favorisant à la fois sa visibilité internationale et des liens étroits avec ses partenaires socio-économiques - grands groupes industriels, PME, start-up, collectivités territoriales, associations...
Site web : https://www.universite-paris-saclay.fr
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